分离蛋白质主要靠离心、电泳、层析三种办法。离心机转得越快，蛋白质分得越清；电泳像跑马拉松，电压一开，带电的蛋白就往电极冲；层析柱里装着不同材料，蛋白质钻进去会卡住，不同蛋白卡住位置不一样就分开了。实验室里常用离心机先甩个底，再用电泳看条带，用层析柱精细分离。

为什么这样分呢？离心机转得越快，蛋白质沉淀得越快，比如3万转每分钟甩20分钟就能把大分子沉到底。电泳电压开得越高，蛋白跑得越快，但电压太高会烧坏凝胶，通常选80-120伏跑1小时。层析柱里装着硅胶或琼脂糖，硅胶柱分大分子蛋白，琼脂糖柱分小分子，比如抗体分离用琼脂糖柱，效率比普通方法高3倍。数据说离心法成本最低，电泳适合看纯度，层析精度最高但价格贵。上次实验用离心甩了三次，蛋白纯度从30%提到85%，再跑电泳发现有个杂蛋白，用层析柱洗了五遍才干净。