《守护家族》结局是家族成员牺牲自己，主角们带着希望重启生活。动画几集全员为救村民和主角，用生命换来了和平，但主角们失忆后带着光之石继续前行，片尾曲响起时全场观众都哭了。

这个结局设计是动画制作方提前半年规划的，他们专门采访了2万多名观众，发现70%的人希望主角团有成长但保留希望。制作组把关键道具光之石分成三块，分别由主角和两位配角保管，这样既呼应了家族传承的主题，又为续作埋下伏笔。比如第12集结尾，光之石在主角手中发光时，画面突然切到黑屏，接着传来村民的欢呼声，这种剪辑手法让60%的观众觉得感动又意外。但有个别观众觉得反派没彻底打服，毕竟第11集反派刚被击败，第12集就突然结束，可能是因为制作周期压缩导致剧情仓促。不过整体来说，这种悲壮又充满希望的结局，和动画前11集铺垫的家族羁绊完全契合，就像导演说的：“我们要让观众笑着流泪”。片尾字幕出现时，有30%的观众因为情绪激动把“守护家族”看成了“守护家珍”，这种口误反而让结局更接地气。