暗杀教室总共有25集，每集25分钟，分两季播出。动画由京都动画制作，剧情围绕转学生与特殊学校的故事展开。有些观众可能会觉得集数少，但实际每集内容很紧凑，关键情节都集中在前面几集，后面几集主要是收尾和补充细节。

因为动画是2015年首播的，当时分两季播出，第一季12集，第二季13集。单集时长固定25分钟，加上片头片尾和广告，实际每期节目时长约40分钟。京都动画在制作时为了控制成本，把主要剧情压缩在25集内，所以看起来集数不多但信息量很足。比如第一季第7集就出现重要反派，第二季第12集就迎来最终决战。这种紧凑的节奏导致有些观众在追番时容易漏掉关键集数，特别是第5集和第19集的转折点。动画里还有3集特别篇，但不算在正片25集里，这也是容易混淆的地方。