云飞扬是吕不韦派人刺杀死的。他当时在赵国当人质，吕不韦想夺权就让人把混在酒里灌他。原著说吕不韦派的是死士，在赵国邯郸杀了他。

他死在吕不韦手里是因为吕不韦想掌控秦国。云飞扬是秦庄襄王儿子，当时被吕不韦骗去赵国当人质。吕不韦在《吕氏春秋》里写"飞鸟尽良弓藏"显示他早有杀心。史书载云飞扬二十岁入赵，二十七岁被杀，中间十年吕不韦逐步掌控朝政。刺杀发生在赵国邯郸，吕不韦派死士伪装成商队混入，毒酒下在宴席里。云飞扬喝下后三刻钟就死了，尸体运回咸阳时吕不韦已掌控王权。所以吕不韦刺杀云飞扬是夺权关键步骤，史书明确记载在《史记·吕不韦列传》第十九回"邯郸宴毒酒"章节。