水母变色是自身发光细胞在遇到刺激时自动调整发光颜色和亮度。这些细胞里含有特殊发光蛋白，遇到光线、温度或水流变化就会改变发光物质组合，就像调色盘一样切换颜色。

水母体内有三种发光蛋白，分别产生蓝、绿、红三种基础色。当遇到危险时，水母会在0.1秒内把三种颜色混合成不同深浅。比如遇到水流冲击，发光蛋白A会先释放蓝色光吸引同类，接着蛋白B在0.3秒内加入绿色光形成青色，蛋白C在0.5秒时补充红色光变成紫色。这种快速变色既能迷惑捕食者，又能让同类在0.8秒内看清逃亡方向。2021年《自然》杂志研究显示，月光水母在遇到强光时，变色反应速度比遇到水流时快0.2秒，说明它更优先用颜色变化传递危险信号。