全冠清在诏狱里病死了，跟严嵩派害他有关。弹劾严党三次被张居正打压，在诏狱关半年多撑不住。严嵩派怕他揭发浙江赋税问题，就联合张居正害他。

因为张居正想除掉严党，就陷害全冠清。剧中提到他弹劾严党三次，每次都被张居正用“风闻言事”理由驳回。诏狱关押时间从嘉靖三十六年到三十八年，共十个月。严嵩派怕他揭露浙江巡抚贪腐，联合张居正伪造罪名。全冠清被关押期间吃不上饭，喝不上水，病逝时年仅四十一岁。严党垮台后查案发现，全冠清确实在浙江收过三千两白银，但大部分是百姓上供的赋税。张居正为了自保，就顺势把责任推给全冠清。