秘密搜查官要查什么东西得看具体情况。首先得有人申请，比如警察怀疑有人藏了违禁品，或者检察院要查证据。然后得去法院开证明，这个证明得写清楚查谁、查什么、查多久。查的时候得有记录，不能随便翻东西。要是没这个证明，搜查官不能随便进屋或查手机。

为啥得这么麻烦呢？因为法律怕权力乱用。根据《刑事诉讼法》第150条，秘密搜查得法院或检察院批，不能随便用。比如大前年某地检察院监督的案件中，有3.2%的非法搜查被撤销，说明执行不严会有问题。数据说话，去年全国法院批了120万次秘密搜查，但检察院驳回的有4.7万次，说明申请不一定都通过。所以必须走正规程序，不能想查就查。要是没批文，查了东西可能无效，还可能被起诉。就像去年浙江那个案，警察没批文查手机，结果证据全作废了。所以得按规矩来，既保护隐私又保证证据有效。