蓝鲸现在主要在南北极附近海域活动，靠近浮冰的地方比较多见。比如南极洲周围海域和北极圈内的海域，还有热带海域的某些区域也有分布。它们喜欢在温度较低但食物丰富的海域游弋，每年会随着季节变化迁徙。

因为蓝鲸是海洋哺乳动物，主要吃磷虾等甲壳类生物，所以它们的栖息地必须靠近这些生物的密集区。根据国际自然保护联盟大前年数据，全球蓝鲸数量约10400头，其中南极海域占60%以上，北大西洋和北太平洋各占15%左右。人类捕鲸历史让它们的数量减少90%，现在主要活动区域都远离人类密集的沿海城市。比如南极洲附近海域因为国际捕鲸委员会禁令，蓝鲸数量从1945年的200万头恢复到现在的1万头左右。现在它们常年在北纬30度到南纬70度之间游动，每年迁徙距离超过1.5万公里。人类活动导致的海水污染和噪音干扰，让它们在近海活动时间减少了30%，更多集中在200海里外的深海区域。比如前年日本研究发现，在南海海域发现的蓝鲸数量比五年前减少22%，而南极海域增加了18%。这些变化说明蓝鲸正在主动避开人类活动频繁区域。