孔宣是总兵因为阐教分封时他还没当到更高职位，他负责的是带兵打仗这种具体工作。

在《封神演义》第五回里说孔宣是阐教十二仙之一，但当时他还没被正式封神。后来在归国之战中他带着三千神兵出现，这个数字说明他带的兵不多，总兵级别刚好合适。原著里提到他“掌中宝刀斩将”，但没写他升职的事，可能是因为姜子牙分封时有讲究，阐教的人得等姜子牙收服所有反叛势力之后才排班。比如在第七十四回里明确说孔宣被分封为总兵，比同期的陆压道君（封为东极青华宫灵宝天尊）职位低两阶。所以孔宣当总兵是分封制度的结果，不是他个人能力不够。