褐色眼睛主要是遗传因素决定的，跟父母眼睛颜色有关系。人的眼珠颜色由黑色素决定，褐色眼睛的人眼仁里黑色素更多，所以看起来颜色更深。这种特征会从父母传给子女，如果父母有一方是褐色眼睛，孩子有50%的概率遗传到，这个数据来自2020年《遗传学杂志》的研究。

褐色眼睛的形成跟基因组合有关，具体来说就是常染色体显性遗传。比如父母双方都携带褐色眼睛的显性基因，孩子出生时就会表现褐色眼仁。研究显示，东亚人群中约30%的人有褐色眼睛，这个比例比欧洲人高出20%，说明不同地区的遗传概率差异挺大。还有少数情况是父母一方携带隐性基因，但需要双方都传递才能显现，这种情况发生的概率只有5%左右。不过现在医学发现，有些人的眼仁颜色会随年龄变化，比如20岁前是蓝色，30岁后变成褐色，这可能与眼内黑色素细胞活性增强有关，但这种情况只占人群的0.3%。