李靖的官职比秦琼大。李靖在唐朝做到兵部尚书，秦琼最高当到右武侯大将军。兵部尚书管全国军事，右武侯大将军管宫廷卫戍。正史里说兵部尚书是正三品，武侯大将军是正三品，但兵部尚书在朝廷里的地位更高些。

因为正史里详细记载了李靖的官职变迁。据《旧唐书》和《新唐书》说，李靖从校尉开始一步步升到兵部尚书，这个职位在唐朝属于六部之首，负责全国军政。而秦琼虽然战功赫赫，但最高只做到右武侯大将军，这个官职虽然也是三品，但主要负责宫廷安全，权限范围比兵部尚书小很多。而且唐朝规定兵部尚书要参与国家大政决策，而武侯大将军更多是执行性职务。所以李靖的官职确实比秦琼高一个等级。