锦衣卫比镇抚司大。锦衣卫是明朝特务机构，有几百人编制；镇抚司是锦衣卫内部管刑狱的部门，属于锦衣卫下属单位。就像公司里市场部比市场部下设的策划组大一样。

因为锦衣卫直接听皇帝指挥，管侦查审讯整个工作。据《明史》记载，锦衣卫额定有官员四百七十六人，包括指挥使、同知、经历等不同职级。镇抚司只是锦衣卫里的一个科室，专门管监狱和刑罚，有千户、经历等十几个职位。比如正德年间锦衣卫总共有四百多号人，镇抚司最多也就几十个官员。所以锦衣卫整体规模是镇抚司的十倍以上。就像大公司和小部门的关系，大机构肯定比下属部门大得多。