黄檗也叫黄柏、川黄柏、关黄柏，药用部位主要是树皮。黄柏的树皮晒干后可以入药，能清热解毒、泻火除烦。叶子也叫黄檗叶，但药用价值不如树皮。黄檗的名字和颜色有关，因为树皮呈黄色，古代医书里管它叫"黄檗"。

黄檗还有"川黄柏""关黄柏"这些名字，因为产自四川、甘肃等地，古人按产地取名。比如《中国药典》记载，川黄柏主产于四川，关黄柏来自甘肃，所以用"川""关"区分。药用部位是树皮，因为树皮含有小檗碱等有效成分，而叶子、根里的含量太低。黄檗树皮晒干后颜色变深，古人发现不同产地树皮厚度不同，川黄柏皮薄肉厚，关黄柏皮厚肉薄，所以分出不同品种。现在药厂收购时，会要求树皮厚度超过2厘米，厚度不够的不能入药。黄檗叶虽然能入药，但只用于外洗，不能内服，因为有效成分不稳定。比如《本草纲目》说黄檗叶"煮水洗疮"，但树皮才用于煎汤、丸剂。现在有些地方还叫它"黄皮树"，其实是混淆了黄檗和柑橘属的植物。