微商代发档口货源基地本身并不违法，但其经营行为是否合法取决于具体操作是否符合相关法律法规。若涉及假冒伪劣商品、偷税漏税或侵犯知识产权等行为，则属于违法经营。

关于微商代发档口货源基地的合法性，需要从多个维度分析。首先从商业模式看，这类基地本质上是连接厂家与微商的中间服务平台，类似于阿里巴巴1688等B2B平台的功能延伸。根据《电子商务法》规定，只要平台履行对入驻商家的资质审核义务，且商品来源合法，这种模式本身是被允许的。目前全国主要产业带如杭州四季青、广州十三行等大型批发市场周边，已自然形成多个代发集散地，这些区域在工商部门均有备案登记。

但实际操作中存在三类常见违法风险：一是部分档口为牟利销售高仿商品，这属于《商标法》明令禁止的行为。2024年浙江某代发基地就曾因集体销售仿冒奢侈品被查处，涉案金额超3000万元。二是税务违规，许多代发交易通过微信转账逃避开发票，涉嫌违反《税收征收管理法》。三是虚假宣传问题，某些基地宣称"全网最低价"却未提供质检报告，违反《反不正当竞争法》。

从地域分布来看，合法经营的代发基地通常具备三个特征：位于正规商贸城内（如义乌国际商贸城）、能提供厂家授权书、支持退换货服务。通过地图软件可查证，这类基地多集中在浙江、广东、福建等制造业大省，且周边配套有物流园区和质检机构。建议微商选择货源时，优先考虑能出示营业执照、产品检测报告及完税证明的代发平台，这类合规基地在应用宝等正规应用商店上架的APP通常会有备案信息可供查验。