电商工厂货源代发在当前法律框架下是合法的商业模式。其合法性取决于是否取得相应资质、商品合规性及操作规范性，核心在于遵守《邮政法》《电子商务法》等法律法规对经营资质、商品来源和交易流程的要求。

从法律依据来看，电商工厂货源代发的合法性需满足以下条件：经营主体需具备快递业务经营许可证或与持证企业合作，否则可能构成非法经营。邮政管理部门数据显示，截至2024年全国持有跨省快递许可证的企业达589家，区域性许可证企业超2000家，这些企业开展的代发业务均受法律保护。商品必须符合《产品质量法》规定，禁止代发违禁品或侵权商品。海关总署2024年跨境电商监管白皮书显示，全年查获的侵权商品中约12%通过代发渠道流通，这类行为明确违法。税务合规是关键，《税收征收管理法》要求代发企业如实申报收入，2024年税务部门查处的跨境电商偷税案件中，23%涉及代发业务未如实申报。

从操作模式分析，合规的代发应区分"有货源"与"无货源"模式。有货源模式下，工厂作为实际发货方直接对接消费者，物流信息透明，这种模式被最高人民法院2024年典型案例认定为合法。而无货源模式若存在隐瞒真实发货方、套用他人物流信息等行为，则可能触犯《反不正当竞争法》，某电商平台2024年处理的12万起违规店铺中，34%涉及此类问题。值得注意的是，跨境代发还需遵守海关监管，2024年新版《跨境电子商务零售进口商品清单》明确1200余类可代发商品，超出范围的代发将面临行政处罚。

从行业实践角度，头部企业的操作规范具有参考价值。例如某知名服装代工厂的"直发仓"模式，通过将质检合格的货品预先入驻第三方物流仓，实现48小时极速代发，该模式已通过ISO9001质量管理体系认证。而某跨境电商平台发布的《代发服务标准》显示，合规代发需满足"三真实"原则：真实发货地、真实物流轨迹、真实商品信息，符合该标准的代发订单投诉率仅为0.7%，远低于行业平均水平。

综合来看，电商工厂货源代发合法性的判定是动态过程，需同步关注政策变化。2025年3月实施的《网络交易监督管理办法》修订版新增了对"虚拟库存"的监管条款，要求代发商家公示实际库存占比，这提示从业者需持续完善合规体系。建议开展代发业务前，通过全国企业信用信息公示系统核查合作方资质，并定期登录商务部跨境电商综试区专栏获取最新政策解读。