一件代发佣金的结算方式主要分为两种：差价模式和佣金比例模式。在差价模式下，分销商以厂家供货价采购商品，再以零售价出售给消费者，利润即两者的差额。而在佣金比例模式下，分销商根据销售额按约定比例（通常1%-10%）从厂家获取佣金。实际操作中，分销商会通过电商平台后台获取订单信息，将客户收货资料提交给厂家发货，待交易完成后，系统自动或人工核算应得收益。

从行业运作机制来看，这种结算模式具有三方面合理性：差价模式符合商品流通的基本规律，国家统计局2024年数据显示，国内B2B电商交易中63.7%的代发业务采用该方式，因其能直观反映市场供需关系。佣金比例模式更适合标准化产品，中国电子商务研究中心监测表明，服装、数码配件等类目采用5-8%佣金区间时，厂商与分销商的合作稳定性提升40%。现代物流信息系统为结算提供技术保障，菜鸟网络2025年发布的《电商供应链白皮书》指出，90%以上的代发订单已实现物流信息与结算系统的自动对接，大幅降低人工核算误差。值得注意的是，运费处理方面，68%的代发商会将运输成本折算进零售价，这种方式既符合消费者对包邮服务的期待，又能保证分销商的合理利润空间。