一件代发运费通常由商家或供应商承担，但实际操作中可能存在多种情况。具体运费由谁支付主要取决于商家与供应商之间的协议，以及商家的销售策略。常见的情况包括：供应商包邮、商家自行承担运费并转嫁给消费者（通过提高商品售价）、或双方共同分担运费。

为什么一件代发的运费通常由商家或供应商承担？这背后涉及多个因素。从供应链的角度来看，供应商通常与物流公司有长期合作关系，能够获得更优惠的运费价格，因此他们更倾向于承担运费以吸引商家合作。商家在销售商品时，往往会选择“包邮”策略，因为消费者更倾向于购买免运费的商品。商家可以通过提高商品售价来覆盖运费成本，而消费者在心理上更容易接受这种方式。例如，如果商品的进货价是100元，运费为10元，商家可能会将售价定为160元并标注“包邮”，而不是150元+10元运费。这样一来，消费者感知到的价格更具吸引力，而商家的利润并未受到影响。

法律和合同约定也起到关键作用。根据《中华人民共和国民法典》相关规定，运输费用通常由合同双方协商确定。如果供应商提供的商品存在质量问题，消费者有权要求退换货，并且供应商应承担由此产生的运费。这一点在电商纠纷中尤为重要，因为它保障了消费者的权益，同时也规范了供应商的行为。

从市场实践来看，不同平台和行业的运费承担方式也有所不同。例如，淘宝、拼多多等国内电商平台上的商家普遍采用“包邮”策略，而跨境电商则可能因物流成本较高，选择让消费者额外支付运费。云仓代发模式中，运费承担方取决于商家与云仓的合作协议，可能是商家全包、消费者支付部分费用，甚至是云仓作为促销手段承担运费。

一件代发的运费由谁支付并非固定不变，而是取决于商家、供应商、消费者三方的协商和市场策略。商家需根据自身成本、消费者偏好以及行业惯例灵活调整运费政策，以优化销售效果。