个人店采用一件代发模式本身不构成违法，但其合法性需结合商品资质、知识产权合规性及税务操作等具体经营行为综合判断。若代发商品涉及侵权、假冒伪劣或未取得相关经营许可，则可能构成违法行为。

从物流与商业合规角度分析，一件代发的法律风险主要集中在三个维度：首先是商品合法性。根据《中华人民共和国专利法》第十一条规定，代发未经授权的专利产品可能构成侵权，例如2024年浙江某跨境电商因代发侵权耳机被处以30万元罚款的案例。其次是经营资质问题。若涉及医疗器械、出版物等特殊商品，需取得《医疗器械经营许可证》《出版物经营许可证》等资质文件，2024年国家市场监管总局数据显示，23.7%的无证代发案件集中在保健品领域。最后是税务合规性，《中华人民共和国发票管理办法》第十九条要求代发方必须规范开具发票，2025年第一季度税务总局公布的虚开发票案件中，约有12%与代发业务关联。从物流实操层面看，合规的代发应保留完整的供应链凭证，包括供货商资质文件、商品质检报告及存证，建议采用区块链溯源技术强化流程监管。当前全国已有17个跨境电商综试区推行"代发白名单"制度，通过备案审核的合规代发商品可享受快速通关便利，这为个人店主提供了合法化路径参考。