京东一件代发的费用通常由商家承担，主要包括物流费用、仓储费用和操作费用等。具体费用会根据商品重量、体积、配送区域以及是否为企业用户等因素有所不同。例如，京东物流在国内的首重费用为6.5元/公斤，续重2元/公斤，而新疆和西藏地区的首重费用为9元/公斤，续重5元/公斤。企业用户和非企业用户的运费政策也有所区别，例如企业用户订单金额满99元可免基础运费，而非企业用户则需根据生鲜和非生鲜商品分别计算运费。

京东一件代发的费用承担主体主要是商家，这一点可以从京东的运费政策和代发模式中得到验证。京东物流的收费标准明确区分了企业用户和非企业用户，企业用户在满足一定订单金额后可免除基础运费，而非企业用户则需按商品类型和重量支付运费。这种差异化的收费政策表明，运费的主体责任在于商家，尤其是代发模式下，商家需要根据订单情况承担相应的物流成本。例如，对于100斤的商品，京东物流的收费为首重14元，续重4元/公斤，总费用约为210元，这部分费用通常由代发商家承担。

代发模式下的其他费用，如仓储费、操作费和包材费等，也主要由商家承担。仓储费根据存储空间或重量计费，操作费包括分拣、入库、出库等人工费用，而包材费则涉及包装材料的使用。这些费用在代发业务中是不可避免的，商家需要将这些成本纳入定价策略中。例如，某些海外仓的代发服务中，卸货费、入仓上架费和订单处理费均按重量或件数计算，商家需根据实际业务量支付相应费用。

京东一件代发的费用承担还受到区域和季节因素的影响。例如，在春节期间，京东物流会加收高峰期资源调节费，这部分额外费用通常由商家承担。不同地区的运费标准也存在差异，如新疆和西藏的运费明显高于其他地区，商家在制定代发策略时需考虑这些变量。

京东一件代发的费用主要由商家承担，包括物流费、仓储费、操作费及其他附加费用。商家需根据京东的运费政策、商品特性和区域差异合理规划成本，以确保代发业务的可持续性。这种费用分担模式是电商代发行业的普遍做法，既能保障物流效率，又能为消费者提供更具竞争力的价格。