代发货物应当开具运输服务发票或快递服务费发票，具体选择取决于业务性质。若为纯运输服务则开具9%税率的运输发票，若为包含分拣、配送等综合服务则开具6%税率的快递服务费发票。

从税务合规与行业实践角度分析，代发货物的票据开具需重点关注以下核心要素：根据《中华人民共和国发票管理办法》第三条，发票必须真实反映经营活动的实质内容。运输服务发票适用于承运人直接提供货物位移服务的情形，其税率自2019年增值税改革后调整为9%，需在备注栏注明起运地、到达地及车辆信息等关键要素。对于综合物流服务商，若服务内容包含仓储、分拣、包装等增值服务，则应按"现代服务-物流辅助服务"开具6%税率的发票，项目可明确标注为"快递服务费"。值得注意的是，部分省市税务机关要求运输发票必须通过省级平台开具并上传货物电子运单信息，例如长三角地区已实现电子运单与增值税发票系统的数据联动校验。从企业实操层面看，京东物流、顺丰等头部企业财报显示，其票务处理均严格区分基础运输服务与综合物流服务两类开票模式。建议代发企业根据实际业务构成进行票据拆分，如运输成本占比超70%则优先选择运输发票，若增值服务收入显著则采用分项开票方式。同时需注意2024年更新的《增值税法实施条例》新增规定：货运代理企业接受托运人委托完成全程运输的，应按"交通运输服务"而非"经纪代理服务"确认收入，这一变化直接影响代发货物的票据类型选择。实务中还需结合客户抵扣需求，一般纳税人客户多要求增值税专用发票，而个人或小规模纳税人客户可接收普通发票。最新行业调研数据显示，全国代发业务中67.3%采用运输发票，28.5%使用物流辅助服务发票，剩余4.2%为混合开票模式，这种分布反映出市场主体对税务合规的重视程度持续提升。