在代发货业务中，运费的承担方主要取决于商家与云仓或物流服务商的合作协议，同时也受商品性质、销售策略和消费者协议的影响。通常情况下，运费由商家全额承担最为普遍，其次是消费者支付或双方共同分担的模式，特殊情况下云仓也可能承担部分运费。

代发货模式下的运费分配机制涉及多方利益平衡，其核心依据可归纳为三个层面：合同约定、行业惯例和法律规范。从合同层面看，商家与云仓签订的服务协议通常会明确运输费用的归属，这是判定责任的首要依据。行业数据显示，约67%的电商代发业务采用商家全包运费模式，这种模式能提升消费者购买意愿，但会抬高商家运营成本约12-15%。在消费者权益保护法框架下，因商品质量问题产生的退换货运费必须由经营者承担，这与传统物流合同的过错责任原则一脉相承。值得注意的是，部分云仓企业为拓展市场会推出阶段性运费补贴政策，但这种优惠通常限于特定区域或商品品类。从操作实务看，代垫运费情形需满足承运发票直接开具给购买方且完成票据转交的要件，否则可能产生额外的税务成本。对于跨境代发货业务，还需考虑国际贸易术语（如FOB、CIF等）对运费划分的特别约定。当前物流行业正在向智能化方向发展，部分平台已实现根据实时路由数据动态分配运费比例，这种技术革新未来可能重塑传统的运费承担模式。