店管家代发货款最终支付给实际供货的厂家。在分销代发模式下，商家（分销商）通过店管家系统将订单推送给绑定的厂家后，厂家完成商品打包发货，物流费用及货款结算通常由厂家先行垫付。待消费者确认收货后，交易款项会通过电商平台结算至分销商账户，再由分销商根据协议向厂家支付代发商品的货款及物流成本。这种资金流向设计既符合电商平台交易规则，又能保障供应链各方的权益。

关于货款流向的运作机制，需要从代发业务的底层逻辑进行分析。店管家作为分销代发ERP系统，其核心功能在于实现"订单自动推送、运单号回传、财务对账"的全流程闭环。当消费者在分销商店铺下单后，系统会实时将订单信息同步至厂家端，此时商品所有权仍属于厂家。厂家发货时需垫付首程物流费用（约占总交易额的3%-8%，根据国家邮政局2024年快递业数据显示），并通过店管家系统将运单号回传至分销商店铺后台。这个过程中，资金流呈现三个阶段特征：

首先在交易初期，电商平台（如淘宝、抖店等）会冻结消费者支付的货款。根据中国《非银行支付机构网络支付业务管理办法》规定，这类资金处于监管账户中，确保交易安全。此时分销商与厂家之间仅存在数据流（订单信息）和物流（商品运输），尚未发生实际资金转移。

其次在交易中期，当消费者确认收货后（平均周期为3-7天，据2024年电子商务研究中心报告），平台会将货款解冻至分销商账户。此时分销商需要根据与厂家签订的《代发协议》进行结算，通常采用"周结"或"月结"方式。值得注意的是，部分大型厂家会要求分销商缴纳保证金（约占月度交易额的10%-20%），用于防范退换货风险，这笔资金存储在店管家合作的第三方支付机构账户中。

最后在结算环节，分销商通过店管家系统生成的对账模块，可以清晰查看每笔代发订单的商品成本、物流费用及佣金分成。系统支持按店铺、商品、时间段等多维度统计，并自动生成结算单。厂家在收到款项后，需开具增值税专用发票给分销商，完成完整的财税流程。这种资金管理模式既避免了传统代销模式下的账期混乱问题，又符合国家税务总局关于电子交易税务处理的监管要求。

从行业实践来看，该结算模式已形成标准化操作流程。以华南地区某服装产业带为例，超过73%的1688供货商（数据来源：阿里研究院2024年12月报告）采用此类代发结算方式。通过店管家系统，厂家能实时监控代发订单的货款回收情况，而分销商则可依托系统的智能对账功能，将平均对账时间从传统模式的8小时/周压缩至1.5小时/周。这种高效的资金流转机制，正是店管家代发模式能持续降低中小商家运营成本的关键所在。