一件代发模式中收取快递费的核心原因在于物流环节实际产生的成本需要覆盖。商品从仓储到终端配送涉及基础运费、仓储管理、订单处理等刚性支出，这些费用通常由商家或消费者承担。若一件代发声称"包邮"，实际已将运费成本分摊至商品售价中。

从物流行业运作机制分析，一件代发的费用构成具有必然性。基础运费根据重量、体积和配送距离计算，例如国内主流快递企业针对首重1kg内包裹收费标准为5-15元，续重每公斤增加1-3元，跨省运输成本可达省内件的1.5-2倍。仓储环节产生分拣费（约0.3-0.8元/件）、入库出库操作费（1-2元/单）等固定成本，专业云仓的存储费用更达0.5-2元/平方米/天。以广州发往乌鲁木齐的3kg化妆品为例，其物流总成本可达28-35元，包含12-15元基础运费、6-8元续重费、3元包装材料费及7-10元偏远地区附加费。

乡镇地区的二次收费现象则暴露了物流网络覆盖的局限性。部分快递企业未在偏远乡镇设立正式网点，依赖第三方代理点完成"最后一公里"配送，这些代理点通过收取3-10元"代送费"弥补运输损耗。尽管《快递服务》国家标准明确禁止违规收费，但2024年邮政业申诉数据显示，乡镇快递二次收费投诉仍占服务类投诉总量的17.3%，反映出基础设施不足导致的成本转嫁问题。

增值服务的差异化定价也是重要因素。代收货款服务收取交易金额1-3%的手续费，保价服务按声明价值0.3%-1%计费。某跨境电商平台2024年物流白皮书指出，使用定制包装的订单客单价提升12%，但相应增加2-5元/单的包材成本。这些个性化需求客观上推高了整体物流支出。

从商业模式看，1688等平台商家采用"运费分离"报价更符合商业。将商品价格与运费分开列示，既避免价格误导，又方便买家比较不同物流方案。数据显示，明示运费的店铺退货率比"包邮"店铺低23%，因消费者对总成本有明确预期。值得注意的是，部分不良商家通过虚报重量或拆分包裹规避运费上限，这种行为既违反《快递市场管理办法》第28条，也损害行业健康发展。

未来随着自动化仓储和无人机配送普及，物流成本有望下降。但现阶段，一件代发的快递费本质是商品流通的必要支出，其合理性建立在服务透明和成本公开基础上。消费者应警惕明显低于市场价的"全包价"，同时保留快递单号等凭证以便维权。