深圳冻库代发货的收费主要由仓储费、操作费和运输费三部分构成。以深圳市常仔冷藏货运有限公司为例，冷冻仓储费约为150元/平方米/月，分拣包装等操作费按货物重量收取（20元/件起），同城配送基础运费为1.5元/公斤（20公斤起），跨城运输如深圳至郑州的冷冻车整车运费约7000-8000元/车。

深圳作为粤港澳大湾区冷链枢纽，其冻库代发货价格形成受三方面因素影响：一是仓储成本，深圳冷藏库平均租金比广州高15%，主要因土地成本差异和自动化设备投入（如英脉物流采用的全温区智能仓储系统）；二是运输半径，从深圳盐田港到广州黄埔港的冷链短驳运费约300元/吨，而到北京则需26000元/车（2600公里），距离系数直接影响报价；三是温控标准，-18℃深冻仓的能耗成本比0-4℃冷藏仓高40%，反映在药品等特殊货物的运费溢价上。顺丰冷运数据显示，深圳同城冷链零担的轻抛货折算公式（长x宽x高/3000）较普通物流严格20%，确保温控设备空间利用率。当前行业趋势是采用动态计价系统，如夏季荔枝运输高峰期运费会浮动10-15%，建议通过物流公司官网实时查询最新报价。