生鲜入仓代发货模式是合法的商业行为，但其合法性需建立在符合《快递暂行条例》和农产品检疫规范的基础上。该模式通过第三方仓储完成生鲜产品的集中存储、分拣和快递分发，属于现代物流供应链的创新形态。

从法律层面分析，生鲜入仓代发货的合法性主要体现在三个方面：《快递暂行条例》明确规定快件寄递不得从事危害公共利益的活动，但未禁止生鲜产品代发业务，只要运输物品符合检疫标准且包装规范即受法律保护。福建省2025年修订的快递行业管理办法特别强调加盟制企业需承担连带责任，这为代发货模式中的权责划分提供了法律依据。农产品快递合法性已获司法实践确认，生鲜作为农产品子类，在满足冷链运输、检验检疫等专业要求的前提下，其流通渠道受到法律保障。圆通速运等企业处理生鲜件投诉的案例显示，快递企业已建立针对生鲜产品的特殊赔偿机制，侧面印证该模式的合规性。代理发货行为本身不违法，但需确保商品真实性和质量安全，若涉及假冒伪劣则可能触发《产品质量法》追责条款。实际操作中，生鲜入仓代发货需重点关注三个合规要点：仓储环节需符合食品药品监管局的温控标准，运输环节应满足邮政管理部门的安全检查要求，信息环节必须执行实名收寄和快件验视制度。当前中国生鲜电商市场规模已突破1.2万亿元，其中约37%采用入仓代发模式，这种集约化物流方式通过降低冷链运输成本和提高配送效率，正在成为生鲜供应链的主流选择。但需要注意，不同地区对生鲜产品的检疫要求存在差异，例如沿海地区对水产品的检验标准就比内陆更为严格，从业者需动态关注各地检验检疫部门的实施细则更新。