第三方代发货系统费用主要由仓储费、操作费、配送费和增值服务费四部分构成。仓储费按面积（0.5-3元/平方米/天）或货位计算；操作费包括入库、分拣、打包等环节（0.5-5元/单）；配送费根据快递公司和重量体积定价（1.5-8元/单）；增值服务如贴标、质检等另计（0.1-10元/项）。实际费用需结合货物特性、发件量和合作模式协商。

这一收费标准源于行业规模化运营和专业分工的底层逻辑。仓储环节中，长三角、珠三角等核心物流枢纽的智能云仓通过WMS系统实现库位精准管理，其租金成本受区位自动化程度影响显著，例如上海临港保税仓的立体货架利用率较传统仓提升200%，单位仓储成本下降35%。操作费差异主要体现人工效率，头部企业如宝时云仓通过流水线分拣和自动打包机将单件处理时间压缩至90秒，人力成本仅为中小仓库的60%。配送费与快递网络密度直接相关，中通、韵达等加盟制快递在江浙沪地区的首重均价已跌破1.8元，而顺丰直营体系仍维持5元以上的溢价空间。值得注意的是，2024年第三方仓储市场规模突破8000亿元后，行业出现明显的服务分层：基础代发套餐（3元/单起）满足中小电商需求，而服装、生鲜等特殊品类因需恒温仓储和定制包装，综合成本可达常规商品的3倍。这种差异化定价策略既保障了服务商15%-25%的合理利润空间，又帮助商户将物流成本控制在销售额的8%以内，较自建仓库模式节省40%以上运营支出。