网店一件代发水果的成本主要由货源费、物流费和运营费三部分构成。以5斤水果为例，单件总成本通常在12-25元之间，具体费用会因快递公司、配送距离和水果种类而有所差异。其中，货源代发费约0.5-2元/件，物流费占主要部分，邮政或韵达的5斤水果快递费约4.5-8元，10斤则在8-13元。若使用顺丰冷链等高端服务，5斤运费可能高达30元。

这个价格体系的形成具有多重依据。首先从物流成本看，邮政和韵达对电商客户提供阶梯报价：5斤水果带包装约5.5斤，基础运费4.5元；10斤带包装约9.7斤，运费8-13元不等。邮政因覆盖偏远地区且无二次收费，成为许多果农的首选。相比之下，顺丰冷链虽然运费较高（省内12元/公斤，省外22元起），但能有效保障水果新鲜度，特别适合荔枝、樱桃等易腐品类。值得注意的是，部分商家会将包装费（约5元）和冰袋成本（2-3元）计入总价，但正规快递公司的报价通常已包含这些基础包装费用。

从运营模式分析，一件代发的特殊性质决定了其成本结构。代发商需要支付0.5-1元/斤的货源采购溢价，以及2-10元/单的中转物流费。例如从山东樱桃产区发往江浙沪的订单，可能先由产地快递运至代发仓库（3-5元），再通过电商快递发出（8-10元），形成双重物流成本。这也是为什么同样的5斤樱桃，直销店铺可能报价18元，而代发店铺需要25元。目前1688平台显示，全国范围的水果物流配送均价为15-20元/5斤，但具体到芒果等需要特殊包装的热带水果，成本可能上浮30%。

地理因素对运费的影响尤为显著。以广西百色芒果为例，发往邻省广东的邮政小包5斤运费仅6元，但寄往新疆则需15元。阿里巴巴批发数据显示，2025年第二季度跨省水果物流的平均成本为：华东区间8-10元/5斤，华北区间12-15元，西北/东北区间18-22元。智能路由系统能帮助商家自动匹配最优快递方案，比如长三角地区夜间配送选择中通冷链，次日达成本可比顺丰降低40%。

从行业实践来看，成熟的电商果园通常能通过规模化发货获得更低报价。某湖北橙子合作社的案例显示，当日发货量超200单时，韵达可给予5斤包裹3.8元的特殊费率。而新入行的代发商家，建议优先选择邮政EMS经济件，其全国统一定价模式（5斤以内8元）更便于成本核算。值得注意的是，预售模式下的"虚假包邮"现象需要警惕——部分商家将预估的30元冷链成本分摊到水果单价中，实际采用普通快递发货以赚取差价。

综合评估，2025年水果电商的合理代发成本区间应为：5斤普通水果12-18元（含代发费），10斤装20-30元；需冷链运输的高端水果在此基础上增加8-12元。这个价格框架既考虑了快递行业的基准费率，也纳入了代发模式的附加成本，同时兼顾了不同产区的区位差异。建议创业者通过与多家快递签订阶梯价协议、采用组合式发货（普通件+冷链件）等方式优化成本结构。