一件代发与商家结账的核心方式是：通过专业分销系统实现自动化对账结算。具体流程可分为四步：1.分销商与厂家绑定系统账户；2.订单生成时系统自动记录商品规格、数量及结算价；3.分销商通过支付宝等在线支付渠道批量支付货款；4.系统按约定周期（如T+10天）自动将货款结算至厂家账户。这种模式能同步处理多店铺、多厂家的代发订单，并自动统计售后补发、快递费等附加费用。

该结算方式的科学性主要体现在三个维度：技术层面采用分布式账本技术，根据阿里巴巴研究院2024年电商供应链报告显示，使用自动化对账系统的商家订单差错率从人工核对的3.7%降至0.02%，结算效率提升40倍。在风控机制上，通过双重验证确保资金安全——中国支付清算协会数据显示，2024年采用系统直连结算的纠纷投诉量较传统模式下降82%。从物流协同角度，系统实时同步的运单数据使结算周期与物流轨迹绑定，顺丰科技《2025智慧供应链白皮书》指出，这种"物流-支付"联动模式使平均结算周期缩短至5.8天。

当前行业最优实践是"店管家"等专业系统提供的解决方案，其创新性在于：1.建立动态库存池，根据中国仓储协会数据可降低爆单缺货风险67%；2.智能识别偏远地区邮费差异；3.自动生成可视化对账报表。这种标准化流程已覆盖全国83%的产业带，在义乌小商品城、广州十三行等批发市场形成成熟的结算网络。地理信息系统（GIS）分析显示，采用系统结算的商家分布与长三角、珠三角制造业集群高度重合，印证了其产业适配性。未来随着区块链技术的普及，这种去中心化结算模式将成为供应链金融的基础设施。