源头商家一件代发的收费模式主要包含货源成本、物流费用和运营成本三部分。货源成本通常按件（0.5-2元/件）或按重量（0.5-1元/斤）收取；物流费用根据快递公司标准计算，首重省内约6-12元，续重2-8元/公斤；运营成本涉及仓储、人工等，日均约100元。部分服务商提供打包价，如服装代发8元/件含质检和售后。

这一收费结构的合理性可从行业数据和物流体系维度解析。货源成本差异源于商品属性，例如服装类标品适合按件计费，而生鲜类需按重量核算保鲜成本。物流费用与运输网络密度直接相关，长三角、珠三角等产业带因快递网点密集，首重价格较中西部低20%-30%。以中通为例，其2024年报显示单票运输成本同比下降8%，但人工分拣成本上升5%，导致续重费用存在区域浮动。运营成本中，仓储费受地段影响显著，如义乌电商仓库租金约为上海郊区的60%，这解释了代发服务商地域价差。头部平台如京东通过规模化降低边际成本，其代发基础服务费稳定在订单额的3%左右，而中小服务商需上浮1-2个百分点以平衡风险。跨境代发则需叠加头程运输（海运约1.2美元/公斤）和海外仓存储费（美国仓月均2.5美元/立方英尺），这些数据均来自国际物流协会2025年第一季度报告。收费体系的精细化设计，本质上是对供应链全链路成本的合理分摊。