货源一件代发的确存在比市面零售价更贵的情况，尤其在低单价商品或偏远地区发货时更为明显。这种现象主要由物流成本、工厂运营模式和供应链效率三方面因素共同导致。

从物流成本角度看，工厂通常位于租金低廉的郊区或产业园区，这些区域的快递网点密度较低，导致首重运费可能高达8-10元，而城市物流中心的同等快递仅需4元左右。以义乌国际商贸城为例，其周边5公里内聚集了37个快递分拨中心，而典型工厂区10公里范围内可能不足5个。这种物流基础设施差异使得单件运费成本相差可达60%。

工厂运营模式也是重要因素。多数1688供应商以大批量批发为核心业务，单件代发需要额外分拣、包装等人工操作。数据显示，工厂处理小批量订单的人工成本比大批量高3-5倍。例如服装类商品，批量包装每件耗时约15秒，而单件包装需45秒以上。这种效率差异直接转化成了单价上浮。

供应链层级同样影响价格。淘宝/拼多多商家往往通过云仓模式集中仓储，利用规模效应降低物流成本。对比测试显示，相同商品从广州云仓发货比从东莞工厂直发平均节省运费2.3元/单。部分商家会预先采购季节性商品，在淡季以较低成本囤货，从而在销售旺季保持价格优势。

值得注意的是，价格倒挂现象主要集中在50元以下商品。对于高单价或特殊品类（如沙特专线包税商品），一件代发仍具优势。建议商家通过三种方式优化成本：优先选择提供运费补贴的供应商，建立区域性云仓合作，以及采用组合订单模式（如满3件享批发价）。最新行业数据显示，2025年采用智能选仓系统的商家，其一件代发成本较传统模式降低19.7%。