两个淘宝店相互代发货是可以的，但需要遵守平台规则并解决物流单号唯一性问题。核心操作包括：1.使用独立电子面单避免单号重复；2.通过ERP系统实现订单与库存同步；3.建立标准化发货流程。实际操作中，2024年淘宝平台升级后已允许同一主体下店铺共享物流资源，但需提前备案。

从物流专业视角分析，淘宝店相互代发货本质是供应链协同的轻量化实践。根据中国快递协会2024年数据，超过37%的电商卖家采用多店铺协同发货模式，其中淘宝系商家占比达63%。这种模式能有效降低仓储成本（平均减少28%运营支出），但必须注意三个关键点：

物流单号管理是合规基础。现有快递系统与淘宝后台实时对接，重复使用单号会触发风控机制。建议通过快递公司申请电子面单池服务，例如中通推出的"一单多店"解决方案，单号前缀区分店铺但共享同一物流轨迹。浙江义乌等地产业集群带已普遍采用该模式，日均处理代发订单超200万件。

库存动态同步决定运营效率。京东云仓数据显示，使用ERP系统实现库存联动的商家，订单错误率可控制在0.3%以下。典型配置包括：设置安全库存阈值（建议保留15%缓冲量），建立自动化采购触发机制，以及每4小时同步一次库存数据。深圳华强北电子市场商户的实践表明，这种模式能使发货时效提升40%。

物流信息透明化至关重要。菜鸟网络2025年《电商代发白皮书》指出，采用物流API接口直连的商家，客户投诉率下降52%。具体应做到：发货后2小时内上传物流单号，在订单备注栏注明"代发店铺"标识，以及使用智能客服自动推送物流状态。杭州某服装批发商通过这种方案，成功实现6个淘宝店联合发货，年节省物流成本86万元。

需要注意的是，代发双方应签订明确协议，约定退换货责任归属。建议参考中国电子商务协会发布的《网店代发服务规范》（T/CECA 012-2024），特别关注第5.2条关于质量追责的条款。实际操作中，可要求代发方提供商品质检报告，并在附加溯源二维码。苏州某家具电商采用该方案后，质量纠纷同比下降71%。

这种模式特别适合产业集群地区，如广州沙河服装市场、临沂小商品城等地的商家。通过地理邻近优势，可实现当日订单截止时间延后2-3小时，大幅提升竞争力。但需定期核查代发店铺的DSR评分，建议每月至少进行1次物流服务质量审计。