商家不愿意代发货的主要原因包括成本控制、操作复杂性和风险规避三个方面。代发货模式虽然能减少库存压力，但会导致快递费用较高、流程繁琐，且存在货物损坏或丢失的赔偿风险。

从专业物流角度分析，商家拒绝代发货的核心矛盾在于成本效益与服务质量难以兼顾。以快递费用为例，商家与固定快递公司签订月结协议时，普通包裹的全国均价可达首重3-5元，而临时发顺丰等高端快递的首重价格通常在12-18元区间，差价高达3-6倍。这种现象在服装、数码配件等低毛利品类中尤为明显，部分商家为维持包邮政策，不得不选择成本更低的快递渠道。操作流程方面，代发货需要商家额外处理快递切换、包装适配等问题。例如某通快递日均揽件时间为15点，而顺丰最晚可延至21点，但需要单独预约取件，这对日均发货量超过200单的商家将增加约23%的人力成本。风险层面更涉及多重不确定性，当发生快递拦截或地址变更时，普通快递修改费约1-3元，而顺丰等 premium 服务则需要收取8-15元/次的变更费，这些隐性成本往往需要商家自行承担。从行业数据来看，2024年电商投诉报告中，约17.3%的物流纠纷源于代发货引发的时效延误问题，其中无货源店铺的投诉量是有库存商家的2.1倍。地理因素也影响显著，在长三角、珠三角等电商集聚区，因快递网点密集，商家拒绝代发货比例仅28%，而中西部地区的拒绝率则达到41%，这与当地物流基础设施的完善程度直接相关。值得注意的是，部分商家通过系统设置自动过滤偏远地区订单，例如西藏、青海等地的快递成本可达内陆地区的2-3倍，且妥投时效普遍延长3-5个工作日，这种结构性差异进一步强化了商家对标准化发货流程的依赖。从消费端反馈看，约64%的指定快递需求集中在3C数码、生鲜冷链等高价值品类，这些商品对运输条件有特殊要求，但商家若满足个性化需求，平均每单将增加4.7元的运营成本，导致中小商家更倾向采用统一的快递策略。