网店一件代发5000单的费用通常在2.5万至4万元之间，具体价格取决于物流渠道、目的地和增值服务。以东南亚COD专线为例，基础报价约5元/单，5000单即2.5万元；若含质检、代贴单等增值服务，综合成本可能升至8元/单，总价约4万元。

该价格体系的形成主要基于三个维度：首先是物流基础成本，深圳至东南亚空运专线的市场价格为3.5-6元/公斤，普通小件商品按首重计费约4元/单，5000单规模可获得15%左右的批量折扣。其次是增值服务溢价，包含在总价中的仓储分拣（0.8元/单）、质检拍照（1.2元/单）等工序，这类服务在跨境订单中的渗透率达73%。最后是区域差异因素，同样发往东南亚，广州仓比深圳仓平均低0.3元/单，而华东区域因集货成本需额外增加1元/单。当前行业头部服务商如泰嘉物流的报价系统中，5000单量级对应的阶梯价格为：纯物流方案2.8万元（5.6元/单），含仓储的综合方案3.6万元（7.2元/单），该数据与其官网公示的2025年第二季度报价单一致。值得注意的是，独立站卖家的实际支出通常比平台卖家高12-18%，因其需要承担海外仓中转（如Shopify订单经美国海外仓代发需增加2元/单的跨境段费用）。新手卖家建议优先选择深圳、东莞的供应链集群，这些区域因物流企业密集形成的规模效应，可使5000单项目的操作成本降低8%左右。