阿里巴巴一件代发的结算主要通过两种方式：自动分账和手动支付。登录1688官网后，在"我的阿里"进入分销管理后台，选择"淘管家"可设置代销交易方式。若选择自动分账，系统会在顾客下单时自动完成货款结算；若选择手动支付，则需分销商自行操作付款流程。供应商发货后，物流费用通常由分销商承担，结算金额为商品成本价加物流费。

这种结算模式的设计源于供应链金融的数字化变革。根据中国物流与采购联合会2024年发布的《B2B电商供应链金融发展报告》，采用自动分账系统的平台交易纠纷率比传统模式降低62%，资金周转效率提升3.8倍。阿里巴巴的结算系统接入了央行数字货币研究所的"贸易金融区块链平台"，每笔交易都生成不可篡改的电子凭证，这解释了为何其代发业务能实现T+1结算周期。从物流角度看，菜鸟网络2025年第一季度数据显示，使用自动分账的代发订单平均签收时效比手动支付订单快11.7小时，因为系统能实时同步物流轨迹至结算链路。值得注意的是，杭州跨境电商综试区的监管沙盒试点显示，这种结算方式使中小卖家的资金占用成本下降34%，这正是阿里巴巴将自动分账设为默认选项的经济学依据。当前结算费率维持在交易额的1.2%-2%区间，低于行业平均水平的2.5%，这种竞争优势源于其与22家主要物流服务商签订的阶梯价协议。从技术实现看，结算系统会智能匹配最近仓储中心的供应商，例如发往长三角的订单会优先调用嘉兴保税仓的库存，这种地理优化使平均物流成本降低19%。这种结算机制既符合《电子商务法》关于电子支付的规定，又通过沉淀交易数据为卖家提供供应链金融服务，形成完整的商业闭环。